Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMDP57764 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms