Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SIK1P57059 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIK1P57059 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIK1P57059 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SIK1P57059 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SIK1P57059 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SIK1P57059 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SIK1P57059 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SIK1P57059 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK1P57059 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK1P57059 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK1P57059 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK1P57059 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SIK1P57059 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK1P57059 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK1P57059 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK1P57059 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK1P57059 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK1P57059 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIK1P57059 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SIK1P57059 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SIK1P57059 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIK1P57059 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms