Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY3P57055 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms