Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP7P55210 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP7P55210 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP7P55210 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP7P55210 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP7P55210 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP7P55210 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP7P55210 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP7P55210 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP7P55210 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP7P55210 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP7P55210 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP7P55210 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms