Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCKAP1LP55160 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCKAP1LP55160 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms