Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRLP54845 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRLP54845 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRLP54845 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRLP54845 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRLP54845 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRLP54845 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRLP54845 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms