Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD23BP54727 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD23BP54727 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms