Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PGGT1BP53609 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PGGT1BP53609 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP53609 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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