Protein–RNA interactions for Protein: P53104

ATG1, Serine/threonine-protein kinase ATG1, yeastyeast

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG1P53104 FLC1YPL221W 2382 nt5.1□□□□□ -1.59
ATG1P53104 YBR238CYBR238C 2196 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 GMC1YDR506C 1827 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 MFA1YDR461W 111 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 SLD5YDR489W 885 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 NTF2YER009W 378 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 SDO1YLR022C 753 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 SHG1YBR258C 429 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 KRE6YPR159W 2163 nt5.09□□□□□ -1.59
ATG1P53104 LST4YKL176C 2487 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 PRP43YGL120C 2304 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 APC4YDR118W 1959 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 AML1YGR001C 747 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YKL069WYKL069W 543 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YOR082CYOR082C 342 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 CMD1YBR109C 444 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YCL022CYCL022C 516 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 GCN20YFR009W 2259 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 MNT2YGL257C 1677 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 MSE1YOL033W 1611 nt5.08□□□□□ -1.6
ATG1P53104 RSC58YLR033W 1509 nt5.07□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.07□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt5.07□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YOR248WYOR248W 303 nt5.07□□□□□ -1.6
ATG1P53104 PDR15YDR406W 4590 nt5.07□□□□□ -1.6
ATG1P53104 ALG6YOR002W 1635 nt5.07□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SEC2YNL272C 2280 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 FAP1YNL023C 2898 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YDR269CYDR269C 324 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SLX8YER116C 825 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 ECL1YGR146C 636 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 RPS4BYHR203C 786 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 RPS4AYJR145C 786 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 CSE4YKL049C 690 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 VPS63YLR261C 327 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 CAT5YOR125C 702 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 CBP3YPL215W 1008 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 PHO88YBR106W 567 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 MRPS9YBR146W 837 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 HUL5YGL141W 2733 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 GPR1YDL035C 2886 nt5.06□□□□□ -1.6
ATG1P53104 GAL80YML051W 1308 nt5.05□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SKG3YLR187W 3081 nt5.05□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YGR153WYGR153W 654 nt5.05□□□□□ -1.6
ATG1P53104 DPH1YIL103W 1278 nt5.05□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.05□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YML084WYML084W 309 nt5.05□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SVS1YPL163C 783 nt5.05□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YDR115WYDR115W 318 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YEL067CYEL067C 588 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 GET1YGL020C 708 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 ECM34YHL043W 513 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 IRC18YJL037W 675 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 IES3YLR052W 753 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YNL146WYNL146W 303 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 CBF5YLR175W 1452 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 ROK1YGL171W 1695 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 TAF12YDR145W 1620 nt5.04□□□□□ -1.6
ATG1P53104 RSM24YDR175C 960 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YFL015CYFL015C 495 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YHI9YHR029C 885 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 TPM2YIL138C 486 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YPL034WYPL034W 498 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YPL107WYPL107W 747 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 VID22YLR373C 2706 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 RNT1YMR239C 1416 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 EPO1YMR124W 2832 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 RPN3YER021W 1572 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YML096WYML096W 1578 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 YDL199CYDL199C 2064 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 MNT4YNR059W 1743 nt5.03□□□□□ -1.6
ATG1P53104 SFI1YLL003W 2841 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 OPT2YPR194C 2634 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 PDR12YPL058C 4536 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 SUP35YDR172W 2058 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 snR68snR68 136 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 HNT1YDL125C 477 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 NOP6YDL213C 678 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 YDR340WYDR340W 303 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 ACF4YJR083C 930 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 YPR050CYPR050C 414 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 YCL012CYCL012C 405 nt5.02□□□□□ -1.61
ATG1P53104 BUD22YMR014W 1560 nt5.02□□□□□ -1.61
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