Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LBX1P52954 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LBX1P52954 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LBX1P52954 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LBX1P52954 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LBX1P52954 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LBX1P52954 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms