Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC3P51654 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC3P51654 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC3P51654 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPC3P51654 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPC3P51654 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPC3P51654 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms