Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1GP51170 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1GP51170 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms