Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLAP51003 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLAP51003 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms