Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPT1P50897 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPT1P50897 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPT1P50897 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPT1P50897 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PPT1P50897 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PPT1P50897 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms