Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCAMP50895 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCAMP50895 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCAMP50895 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCAMP50895 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BCAMP50895 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BCAMP50895 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAMP50895 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAMP50895 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAMP50895 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCAMP50895 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAMP50895 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAMP50895 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAMP50895 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCAMP50895 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCAMP50895 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms