Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTHFSP49914 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTHFSP49914 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms