Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGFP49763 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGFP49763 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGFP49763 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGFP49763 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGFP49763 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGFP49763 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGFP49763 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGFP49763 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGFP49763 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGFP49763 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGFP49763 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGFP49763 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms