Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA1P49639 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms