Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMTP48728 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AMTP48728 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMTP48728 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMTP48728 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMTP48728 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMTP48728 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms