Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms