Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UTRNP46939 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UTRNP46939 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UTRNP46939 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UTRNP46939 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UTRNP46939 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTRNP46939 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTRNP46939 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTRNP46939 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTRNP46939 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UTRNP46939 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UTRNP46939 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms