Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4P46934 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD4P46934 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms