Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNT3P45378 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms