Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSFMP43897 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSFMP43897 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSFMP43897 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSFMP43897 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSFMP43897 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSFMP43897 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSFMP43897 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSFMP43897 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSFMP43897 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms