Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CRATP43155 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CRATP43155 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CRATP43155 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRATP43155 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRATP43155 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRATP43155 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRATP43155 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CRATP43155 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms