Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGER3P43115 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGER3P43115 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms