Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A1P43005 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A1P43005 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms