Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YCG1YDR325W 3108 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 CIK1YMR198W 1785 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 MNT3YIL014W 1893 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 TPO5YKL174C 1857 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 TOM1YDR457W 9807 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RMT2YDR465C 1239 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RRT13YER066W 558 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YIL161WYIL161W 708 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 LCL1YPL056C 306 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 APD1YBR151W 951 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 TOM70YNL121C 1854 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 CHS3YBR023C 3498 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 DIA2YOR080W 2199 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YIL169CYIL169C 2988 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 MTL1YGR023W 1656 nt2.73□□□□□ -1.97
DDI1P40087 HEH2YDR458C 1992 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 KRE2YDR483W 1329 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YDR209CYDR209C 414 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YDR535CYDR535C 501 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 CDC55YGL190C 1581 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YGR073CYGR073C 372 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YKL162CYKL162C 1209 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RED1YLR263W 2484 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 SEC65YML105C 822 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 FIG1YBR040W 897 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 PRM4YPL156C 855 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 POL30YBR088C 777 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 POL3YDL102W 3294 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 VPS9YML097C 1356 nt2.72□□□□□ -1.97
DDI1P40087 SEC7YDR170C 6030 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 EXO84YBR102C 2262 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 WHI3YNL197C 1986 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YPR1YDR368W 939 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SMX2YFL017W-A 234 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 FMP32YFL046W 624 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 MPC3YGR243W 441 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 IMP3YHR148W 552 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YLR042CYLR042C 486 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 TEM1YML064C 738 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YOR385WYOR385W 873 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 STE23YLR389C 3084 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ADY4YLR227C 1482 nt2.71□□□□□ -1.98
DDI1P40087 GYL1YMR192W 2163 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RIF1YBR275C 5751 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RRG1YDR065W 1098 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YGL138CYGL138C 1038 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 BRR6YGL247W 594 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 PPX1YHR201C 1194 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 LAC1YKL008C 1257 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 GTT2YLL060C 702 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ILV5YLR355C 1188 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SSP2YOR242C 1116 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ARA1YBR149W 1035 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 GYP7YDL234C 2241 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 NSA1YGL111W 1392 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YGR067CYGR067C 2415 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 DBP10YDL031W 2988 nt2.7□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SMC2YFR031C 3513 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ESL2YKR096W 3588 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 AIM6YDL237W 1173 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RNH202YDR279W 1053 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 ECM11YDR446W 909 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SDS3YIL084C 984 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 DUG3YNL191W 1074 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RPA190YOR341W 4995 nt2.69□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SLI1YGR212W 1407 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 NSA2YER126C 786 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 GLG2YJL137C 1143 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 PIR1YKL164C 1026 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YLR076CYLR076C 423 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YLR400WYLR400W 474 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 MUS81YDR386W 1899 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SKT5YBL061C 2091 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 BNI4YNL233W 2679 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 HFM1YGL251C 3564 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 BEM4YPL161C 1902 nt2.68□□□□□ -1.98
DDI1P40087 EPL1YFL024C 2499 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RTT105YER104W 627 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RGI2YIL057C 495 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YIL174WYIL174W 228 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YKR033CYKR033C 426 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 IRC14YOR135C 342 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RPA43YOR340C 981 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RPL33AYPL143W 324 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 PDC2YDR081C 2778 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 NFT1YKR103W 3657 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 RIX1YHR197W 2292 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 NET1YJL076W 3570 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 BNR1YIL159W 4128 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 PSP1YDR505C 2526 nt2.67□□□□□ -1.98
DDI1P40087 MPS1YDL028C 2295 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 SST2YLR452C 2097 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 MPS2YGL075C 1164 nt2.66□□□□□ -1.98
DDI1P40087 YGR160WYGR160W 612 nt2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms