Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLT4P35916 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLT4P35916 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FLT4P35916 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
FLT4P35916 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FLT4P35916 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FLT4P35916 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FLT4P35916 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
FLT4P35916 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLT4P35916 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLT4P35916 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT4P35916 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT4P35916 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT4P35916 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT4P35916 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT4P35916 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT4P35916 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT4P35916 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT4P35916 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT4P35916 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FLT4P35916 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FLT4P35916 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLT4P35916 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT4P35916 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT4P35916 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT4P35916 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT4P35916 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT4P35916 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLT4P35916 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLT4P35916 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms