Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC8A1P32418 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC8A1P32418 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms