Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXC13P31276 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC13P31276 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms