Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC8P31273 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC8P31273 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms