Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA13P31271 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms