Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA7P31268 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA7P31268 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms