Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID4AP29374 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID4AP29374 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms