Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HMGB2P26583 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HMGB2P26583 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGB2P26583 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms