Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP1P23763 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP1P23763 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms