Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPREP23469 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPREP23469 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPREP23469 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPREP23469 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPREP23469 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPREP23469 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPREP23469 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPREP23469 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPREP23469 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
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