Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGA6P23229 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGA6P23229 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms