Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACO1P21399 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACO1P21399 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACO1P21399 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACO1P21399 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACO1P21399 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACO1P21399 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACO1P21399 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACO1P21399 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACO1P21399 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACO1P21399 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACO1P21399 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACO1P21399 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACO1P21399 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACO1P21399 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACO1P21399 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms