Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2CP19387 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2CP19387 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms