Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXB9P17482 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXB9P17482 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms