Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA2P17301 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms