Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGA1P17096 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMGA1P17096 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms