Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFRAP16234 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms