Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNNT1P13805 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNNT1P13805 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms