Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCP1P13796 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCP1P13796 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCP1P13796 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCP1P13796 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCP1P13796 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LCP1P13796 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCP1P13796 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms