Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGAMP11215 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms