Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRGC1P0CF51 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRGC1P0CF51 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms