Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC175P0C221 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC175P0C221 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms